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如今是安政六年（1859年）九月，是直秀接任箱馆奉行的第二年。他的任命，是幕府在大老井伊扫部头的带领下对北地的大整顿，说起来真是好大的手笔。
安政五年八月，幕府降旨：
箱馆白主合而为一，以闲居的旗本寄合席崛直秀为新的箱馆奉行，任原白主奉行江川英敏为奉行并，许原箱馆奉行堀利熙戴罪立功，以其为新设的箱馆目付。
至于番头、组头等役职，由合并的两家奉行所申报，由江户酌情任命。
连重要的役职任用都基本下放，可见幕府这次是发了狠，下定决心在北地与鲁西亚好好做过一场。
可不发狠也不行啊，内外的巨大压力迫使幕府不得不这么做——鲁西亚在两次白主之战中惨败，给扶桑带来的震动太多了：
首先，被压制下去的齐昭一派有了复出的迹象。
因为两次对外的“大胜”，大名、幕臣和民间中攘夷的呼声又高涨起来，于是从各个渠道，幕府都得到了复起齐昭一系的请求。
“鲁人贪得无厌，屡屡挑起战端，水户隐居老人不出，奈扶桑苍生何?”
齐昭等人一直致力于整顿军备、抵御外侮，积累了几十年的声望，真不是简单打倒的就能完事的。
而且，更要命的是，开国通商的约定刚签署，虽然贸易的好坏还要等明年正式通商才知道，但西洋人大规模入侵的后果却开始显露——西洋人带来的可不光是军船和商品，还有严重的外来疾病！
西洋人带来的疾病，给扶桑带来了巨大创痛的同时，也引发了普遍的攘夷浪潮，这给齐昭一系复出带来了希望。
自安政五年（1858年）五月起，扶桑沿海霍乱大起，起因则可以追溯到造访长崎的米人身上。
密西西比号蒸汽风帆混合战舰，自嘉永七年（1854年）黑船第一次来访起，多次叩港扶桑。而它五月的这次来访，又给扶桑带来了一次深重的灾难。
此船的出发地为中华松江，而由于长发之乱，当地流民聚集，民生困苦，由此而生大疫——说起来，霍乱对中华也是一种外来疾症，其实它本身源于天竺恒河，随着入侵此地的西洋人而流传来开。
本来嘛，长崎奉行所在奉行小栗忠顺的统领下，对西洋人是有一套检疫制度的。可扶桑势弱，这啥好程序也执行不下去。
但谁也不知道，是有人与密西西比号船员有过接触，还是米人公然违例到市井饮食的缘故，反正霍乱最终在长崎大爆发了。
长崎是仅次于大坂、江户和京都的商港，人员流动极其频繁，因此，随后疫病开始蔓延，九州岛、关西、大坂都不能幸免。
更要命的是，密西西比号是给米人特使哈里斯撑场子来的，尽管长崎奉行小栗忠顺多方阻挠，但这艘船还是继续启程前往伊豆下田港，由此在六月将霍乱带到了关东——这件事造成的后果之一，就是日后小栗对西洋人份外强硬，尤其反米。
到了七月，也就是幕府与英吉利签署通商约定的当月，江户霍乱大爆发，甚至连西洋人也难以幸免——这也是当时鲁人北上时英米两国船队没有随行的原因之一，船员大面积病倒，自己的命还顾不过来，哪还有闲心强力围观。
当然，这样也导致鲁人把霍乱带到了白主：
他们在箱馆只有一次短促的登陆，没机会传播疫病，但在白主惨败后被俘虏了四百多人，在被关押的时候霍乱终于爆发了。
在没有直秀乱入的世界里，这次霍乱造成了非常严重的后果：
光是在江户，有记载从当年七月二十七日到九月二十三日，江户人在寺庙消籍的数字达到了惊人的二十八万人之多！
“ 因霍乱全家皆亡，绝嗣、死产者数不胜-->>